Die Bodensee-Stiftung ist eine projektorientierte Umwelt- und Naturschutzorganisation und setzt sich für nachhaltige Wirtschaftsweisen in der internationalen Bodenseeregion und darüber hinaus ein. Aktuelle Handlungsfelder sind:
Erneuerbare Energien, Umweltbildung, Landwirtschaft und Klimaschutz, Unternehmen und Biologische Vielfalt, Gewässerschutz.
Die Bodensee-Stiftung repräsentiert den Bodensee im globalen Seennetzwerk Living Lakes.